串聯(lián)質(zhì)譜的種類很多，常用的是四極桿分析器（簡寫為Q），其次是離子阱分析器（Trap）和飛行時間分析器（TOF）。為了增加結(jié)構(gòu)信息，大多采用具有串聯(lián)質(zhì)譜功能的質(zhì)量分析器,串聯(lián)方式很多，如Q-Q-Q，Q-TOF等。

串聯(lián)質(zhì)譜的主要串聯(lián)方式

質(zhì)譜的串聯(lián)方式很多，既有空間串聯(lián)型，又有時間串聯(lián)型。空間串聯(lián)型又分磁扇型串聯(lián)，四極桿串聯(lián)，混合串聯(lián)等。如果用B表示扇形磁場，E表示扇形電場，Q表示四極桿，TOF表示飛行時間分析器，那么串聯(lián)質(zhì)譜主要方式有：

1、空間串聯(lián)

磁扇型串聯(lián)方式：BEB EBE BEBE等

四極桿串聯(lián)：Q-Q-Q

混合型串聯(lián)：BE-Q EBE-TOF  Q-TOF 

2、時間串聯(lián)

離子阱質(zhì)譜儀

回旋共振質(zhì)譜儀

無論是哪種方式的串聯(lián)，都須有碰撞活化室，從一級MS分離出來的特定離子，經(jīng)過碰撞活化后，再經(jīng)過二級MS進(jìn)行質(zhì)量分析，以便取得更多的信息。

10種串聯(lián)質(zhì)譜優(yōu)缺點(diǎn)的比較

一、 四極桿質(zhì)譜儀，QMS

QMS是常見的質(zhì)譜儀器，定量能力突出，在GC-MS中QMS占絕大多數(shù)。

優(yōu)點(diǎn): 結(jié)構(gòu)簡單、成本低；維護(hù)簡單；SIM功能的定量能力強(qiáng)；是多數(shù)檢測標(biāo)準(zhǔn)中采用的儀器設(shè)備。

缺點(diǎn): 無串極能力，定性能力不足；分辨力較低（單位分辨），存在同位素和其他m/z近似的離子干擾；速度慢；質(zhì)量上限低（小于1200u）。

二、飛行時間質(zhì)譜儀，TOFMS

TOFMS是速度更快的質(zhì)譜儀，適合于LC-MS方面的應(yīng)用。

優(yōu)點(diǎn)：分辨能力好，有助于定性和m/z近似離子的區(qū)別，能夠很好的檢測ESI電噴霧離子源產(chǎn)生多電荷離子；速度快，每秒2～100張高分辨全掃描（如50～2000u）譜圖，適合于快速LC系統(tǒng)（如UPLC）;質(zhì)量上限高（6000～10000u）；

缺點(diǎn)：無串極功能，限制了進(jìn)一步的定性能力；售價高于QMS；較精密，需要認(rèn)真維護(hù)。

三、三重四極桿質(zhì)譜儀，Q-Q-Q

Q-Q-Q質(zhì)譜給四極桿質(zhì)譜儀在保留QMS原有定量能力強(qiáng)的特點(diǎn)上，提供了串級功能，加強(qiáng)了質(zhì)譜的定性能力，檢測標(biāo)準(zhǔn)中常作為QMS的確認(rèn)檢測手段。

優(yōu)點(diǎn)：有串極功能，定性能力強(qiáng);定量能力非常好，MRM信噪比高于QMS的SIM;是常用的QMS結(jié)果確認(rèn)儀器;除一般子離子掃描功能外，Q-Q-Q還具有SRM、MRM、母離子掃描、中性丟失（Neutral loss）等功能（離子阱不行）對特征基團(tuán)的結(jié)構(gòu)研究有很大幫助。

缺點(diǎn)：分辨力不足，容易受m/z近似的離子干擾;售價較高;需要認(rèn)真維護(hù)。

四、 四極離子阱，QTrap

技術(shù)上而言，在傳統(tǒng)Q-Q-Q的四極桿中加入了輔助射頻，可以做選擇性激發(fā)；或者就功能而言，為Q-Q-Q提供了多級串級的功能。

優(yōu)勢：同時具備MRM、SRM、中性丟失和多級串級功能，非常適合于未知樣品的結(jié)構(gòu)解析。

缺點(diǎn)：分辨力還是低了點(diǎn)。

五、線性離子阱，Linear Ion Trap

傳統(tǒng)3D離子阱的增強(qiáng)版本.

優(yōu)點(diǎn)：相對于傳統(tǒng)3D離子阱，靈敏度高10倍以上;多級串級質(zhì)譜.

缺點(diǎn)：相對于Q-Q-Q，還是不能做MRM、中性丟失等特征基團(tuán)篩選功能.

六、飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜，QTOF

QTOF以QMS作為質(zhì)量過濾器，以TOFMS作為質(zhì)量分析器。

優(yōu)點(diǎn)：能夠提供高分辨譜圖;定性能力好于Q-Q-Q;速度快，適合于生命科學(xué)的大分子量復(fù)雜樣品分析。

缺點(diǎn)：成本高;需要仔細(xì)維護(hù)。

七、離子阱-飛行時間質(zhì)譜，Trap TOF

以3D離子阱作為質(zhì)量選擇器和反應(yīng)器，結(jié)合了離子阱的多級質(zhì)譜能力和飛行時間質(zhì)譜的高分辨能力。

優(yōu)點(diǎn)：同時具有多級串級和高分辨能力，適合于未知樣品的定性工作，如糖蛋白的定性。

缺點(diǎn)：由于離子阱容量限制，對于混合樣品的靈敏度欠佳;定量能力弱。

八、 磁質(zhì)譜，Sector MS

磁質(zhì)譜的定量能力是各種質(zhì)譜中更強(qiáng)的。現(xiàn)在已較少使用，僅用于地質(zhì)元素和痕量二惡英的檢測。

優(yōu)點(diǎn)：技術(shù)經(jīng)典、成熟，NIST等MS庫采用的儀器;分辨力非常好（100k，m/&Delta m FWHM），干擾少;靈敏度高，定量能力是各種質(zhì)譜中更好的。

缺點(diǎn)：體積、重量大;售價很高;速度慢;維護(hù)復(fù)雜，很費(fèi)電。

九、傅立葉變換質(zhì)譜儀，F(xiàn)T-ICR-MS

據(jù)說是質(zhì)譜中的貴族，質(zhì)量精度好，幾個月都不需要校正。但是價格也是貴的讓人心寒。

傅立葉變換質(zhì)譜儀的分辨能力更高，常作為科學(xué)研究的裝備。

優(yōu)點(diǎn)：能夠做多級串級，定性能力好;分辨力高;靈敏度很好;

缺點(diǎn)：體積重量大;售價高;速度也較慢;維護(hù)費(fèi)用非常昂貴。

十、 靜電場傅立葉變換質(zhì)譜，Orbitrap

優(yōu)點(diǎn)：高分辨，60k～120kFWHM，質(zhì)量精度高；相對FT-ICR而言，價格稍低（～450kUSD）；

缺點(diǎn)：不能單獨(dú)做串級；分辨力、靈敏度、質(zhì)量穩(wěn)定性等離FT-ICR還有距離。